Я вот таким батником запускаю.
"bitcoin-qt.exe" -gen=0 -rpcuser=xxx -rpcpassword=xxx -rpcport=8335 -rpcallowip=192.168.0.2 -server -debug -datadir=с:\bitcoin\
ну если не делать его сервером, тогда так
"bitcoin-qt.exe" -gen=0 -datadir=с:\bitcoin\
все работает , версия последняя, скачанная с оффсайта.
как вариант указать путь к конфигу , а в нем уже указать папку