Sim, não é sempre que isso acontece, mas normalmente acontece devido a questão de divisão matemática quando se faz a conversão de uma moeda por outra normalmente acaba sobrando um resto que é impossível converter e a exchange não arredonda valores pois isso poderia ser considerado roubo... então essa "poeira" fica constando no saldo.
É realmente isso que o @tg88 disse.
Com um exemplo numérico talvez fique melhor de enxergar. Considere uma moeda que custe 10 satoshis e você possui 10,55 moedas. Você quer transformá-las em BTC, porém no ato da venda, você consegue vender apenas 10,5 unidades resultando em 105 satoshis, pois o 0,05 resultaria em 0,5 satoshi e não existe unidade menor que o satoshi (0,00000001 BTC). Ficando assim 0,5 unidade da moeda de resíduo.
Como é comum comprarmos frações de moedas, ao se desfazermos delas, frequentemente sobrará esses resíduos.