Только некоторые их использовали для достижения каких-то целей и были ограничены в своих полномочиях (инквизиция), а некоторые просто развлекались и делали что хотели (светские власти).
Инквизиция была карательным органом этой "веселой" организации, которая занималась борьбой с ересью, возникавшей как протест против феодалов, одним из крупнейших была Церковь. То есть инквизиция выполняла роль религиозной полиции. Если бы инквизиция в тогдашнем виде существовала сейчас, уважаемого Бальтазара одним из первых поджарили б на костре, во-первых за ник, во-вторых за создание децентрализованной криптовалюты, подрывающей устои государства и церкви, то есть современных "феодалов".
Что касается их гуманности относительно светских властей, тут не все так однозначно. Большинство источников, дошедших до нас написаны как-раз монахами, как единственными грамотными людьми в те темные времена, поэтому имеет место быть обеление своих церковных коллег, относительно светских феодалов, отношения с которыми у церкви зачастую были натянутыми.
Вообще, средневековье - это кромешный ад.