Die Datei müsste man ja einfach löschen können, da das ja nur die Ausgabe der Node ist, dass diese im Hintergrund läuft oder wird darin etwas wichtiges gespeichert?
Ich würde dir aber empfehlen, dass du die Node als systemd-Service einrichtest, wie das geht hat Dirk hier unter "Massa Node als System-Daemon installieren" beschrieben: https://medium.com/@DirksBlog/faq-hilfe-zur-massa-node-4fe6dc1d292d
So wird im Prinzip kein echtes Log geschrieben sondern es werden nur Journaleinträge angelegt. Diese räumt aber Linux automatisch auch wieder zusammen wodurch kaum Plattenplatz belegt wird. Bei mir sind das bspw. seit Beginn der Episode nur insgesamt 50GB für die komplette Linux-Installation.
Du hast so auch den Vorteil, dass Linux dir die Node automatisch wieder neu startet sollte die abstürzen.